Leta i den här bloggen

fredag 29 september 2017

Hubblen vakia universumin laajentumsiesta

 NASAtiedettä

Hubble’s Contentious Constant

Thanks to astronomer Edwin Hubble and others, scientists have known since 1929 that our universe is expanding. Its current rate of expansion is called Hubble’s Constant (H0).  There are two leading ways to measure H0, and for fifteen years, they more or less agreed with one another.
Not anymore, and that’s a big deal.
Here’s why.

In the “Standard Model of Cosmology,” H0 is a crucial ingredient, right up there with the speed of light. H0 factors into everything we know about the universe:  how old it is, how big it is, what it’s made of...  If H0 is ‘tweaked’, we get a different age of the universe, different relative amounts of matter, dark matter, dark energy, and so on.
Unlike the speed of light, however, scientists can’t measure H0 in the laboratory. Instead, H0 has to be inferred from observations of the universe.
One way scientists have measured H0 is to use observations of type 1a supernovae combined with their host galaxies redshifts. Each 1a supernova releases roughly the same amount of light when it explodes. Measuring the amount of light we receive from a 1a supernova tells us its distance. Measuring an object’s redshift, or its increase in wavelength, tells us how fast that object is moving away from Earth. Researchers use many 1a supernovae as distance markers, measuring objects in our local universe then moving out to get a measurement of the universe’s rate of expansion.
The other H0 measurement technique looks at the Cosmic Microwave Background (CMB) -- the “afterglow” from the Big Bang itself. The early universe was hot and dense, light couldn’t travel freely through space. As the universe cooled, the photons were released. This radiation left an imprint, providing insights into the composition of the universe at that time. The CMB can be used to make measurements from the early universe such as the density of dark matter and dark energy. Those measurements can be combined with the model of the evolution of the universe, allowing researchers to infer the rate of expansion of the universe, or Hubble’s Constant.
As these two camps have improved their abilities to measure H0, it has become clear that they disagree. A recent study using the first method yielded an 8% greater expansion rate than the second method’s result.
Now scientists are asking: Are we missing something?
Wendy Freedman, Sullivan professor of astronomy and astrophysics at the University of Chicago says, “It could be that we don’t understand the uncertainties well enough to know why these two methods differ.”
Freedman led a 2001 study using the Hubble Space Telescope to measure H0 via the first method, and is leading a new project to measure it more accurately.
Another intriguing question: Is it incorrect to expect agreement in these measurements of H0? Maybe the Standard Model of Cosmology, which predicts agreement, is wrong. That would send researchers on an exciting search for a new model of the cosmos.
“Do we really know what makes up all of the radiation in the Big Bang?” wonders Freedman. “Is there a new kind of particle we aren’t accounting for? Or are dark energy’s or dark matter’s properties changing over time?
Over the next few years, researchers like Freedman will be trying to poke holes in how each method conducts its analysis -- before possibly invoking a revised model of cosmology.
For more mind-expanding news about the cosmos, stay tuned to science.nasa.gov.

torsdag 28 september 2017

Fibonacci ja virologia- löytyykö jotain luonnon lakia?

Katson  filmin ebolasta ja sen struktuureista.
https://www.youtube.com/watch?v=87z-lxTvnBU
jokainen uusi ebolavirus on mutatoitunut versio, se mutatoituu jatkuvasti.  Rokotetta varten koetetaan etsiä sen genomista  sekvenssikohtaa, joka vastaa  nopeasta muuntumisesta.


HUOM: kalvolipidit fosfatidylseriini (PS)  ja fosfatidylinositoli (PI-lipidi)   plasmakalvon sisälehdessä ovat olennaisen tärkeät viruksen kiinnittymiselle:
EBOV budding occurs from the inner leaflet of the plasma membrane (PM) and is driven by the matrix protein VP40, which is the most abundantly expressed protein of the virus
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4061899/
PIP2 molekyyliä voi vähentää Lithiumilla.
 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10789877
Lithiumin annosta tiedetään että se sopii ihmiselle kun pitoisuutta seurataan. 
Kolesterolia voi vähentää statiinilla. botten up- approaching  -therapy.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26143190https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26143190
Ne voisivat heikentää ebolan virionin rakentumista olennaisesti - mielestäni. ellei sitten  tule uusia truncated - lajeja
Pitäisi katsoa onko kenelläkään ebolasta toipuneella ollut  statiini tai litiumlääkitys.

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4061899/bin/fmicb-05-00300-g003.jpg
Bildresultat för ebola structure




måndag 18 september 2017

Entä immunomodulaatio punkkienkefaliittiviruksen aiheuttamissa oireissa?

Yleensä  joskus ei henkilö havaitsekaan mitään punkkia ja  siten tulee tosi pahoissa  oireissa ja sairaana sairaalaan kuten artikkelin mies, joka kyllä  sittemmin  muisti, että  jokin punkki tuli nypittyä pari viikkoa ennen... Sitten on infektiolääkäreillä  räätälöimistä oireitten lääkitsemisessä ja ylipäätänsä diagnoosin  varmistamisessa.

 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28632298

Tästä on   esikuvallinen artikkeli Lääkärilehdessä nr. 25-26, 2017.

Lakartidningen. 2017 Jun 16;114. pii: ELAI.
Patient med TBE förbättrades snabbt vid behandling med kortison - Evidens saknas dock för värdet av immunmodulerande terapi.
[Article in Swedish]

Abstract

Rapid improvement of tick-borne encephalitis after treatment with corticosteroids Tick-borne encephalitis (TBE) is a viral disease transmitted by ticks. The virus is divided into three subtypes named Western, Siberian and Far Eastern TBE virus (TBEV). Western TBEV is endemic in parts of Europe and Sweden and typically causes a biphasic illness with influenza-like symptoms followed by neurological symptoms ranging from mild meningitis to severe meningoencephalitis and death. Despite an effective vaccine, TBE is increasing in Sweden and Europe. The pathogenesis of TBE is poorly understood; direct infection of neurons as well as immunological reactions mediated by T-cells have been implicated. In some endemic areas, such as Lithuania, patients with TBE are given corticosteroids based on the clinical experience that it results in rapid improvement. However, existing retrospective studies have failed to show beneficial effects of corticosteroids compared to symptomatic treatment in patients with TBE. This case report describes how an elderly man with meningoencephalitis and cranial nerve palsy due to TBE  rapidly improved after administration of high dose corticosteroids.
PMID:
28632298

lördag 16 september 2017

YF ja TBE rokotekombinaatio- olisikohan hyödyllinen?

Itselläni on se onni,että on tullut otettua joskus ennen Israeliin menoa keltakuumerokote, ja myös isorokkorokotuskin- se on saatu  kaksi kertaakin. tässä Stamarilmainoksessa (*)  on teksti, että keltakuumerokote antaa eliniäkäisen suojan.

Sikäli   se rokote toimisi hyvnä prevaksinaationa kun kerrostaa  immuniteettiään  punkkia vastaan, joka on myös flaviviruksia, muta jonka  nykyinen rokote ei ole täysin  suojava  uutta infektoitumsita vastaan.  Tämä on minun mielipiteeni, mtua olen löytänyt vain ydhen viiteen asiasta.  ja sekin on vanha 1980-luvulta eiä lie tehty tutkimusta  nykyään rokotetuilta, jos heillä on jokin muun flaviviruksen rokotus anamneesissa.  Pitäisi ensin saada  retroaktiivinen tutkimus. Nykyaikana onneksi matkustetaan niin paljon ulkomaille että  YF- rokotuksiakin tehtäneen aika paljon.   Se olisi sikäli hyödyllinen tieto, koska  TBE-rokotteen  kehittely paremmaksi voi viedä kaan aikaa.

 Toisaalta  saako TBEV virukselle luonnollista  immuniteettia ?? Siitäkin löydän artikkelin(**)

Stamaril är avsett för personer som reser till, passerar genom eller bor i ett område där gula febern finns eller reser till ett land där det krävs ett bevis på genomgången vaccination för inresa. Även mellanlandningar i ett land som av slutdestinationen klassas som gula febern-område kan föranleda krav på dylikt bevis. Ett sådant kan bara utfärdas av särskilt certifierade vaccinationsmottagningar, och gäller från 10 dagar efter vaccinationen. Skyddet är livslångt. I vissa fall kan det på grund av medicinska eller andra ställningstaganden vara lämpligt att istället skriva ett intyg om undantag från vaccination, och den bedömningen görs i så fall inför varje resa.

(**)Maria Elena Remoli
3.47 · Istituto Superiore di Sanità
Abstract
Tick-borne encephalitis (TBE) virus infection elicits a life-long lasting protection. 
However, little is known about the neutralizing antibodies titres following natural infection. In this study, subjects with past TBE disease (n = 62) were analysed for the presence and titre of anti-TBE neutralizing antibodies, and compared with a vaccinated cohort (n = 101). Neutralizing antibody titres were higher in individuals with past TBE and did not show an age-dependent decrease when compared with vaccinees.

http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jmv.1890170106/abstract
 

Human antibody response to immunization with 17D yellow fever and inactivated TBE vaccine

Author

  • First published: Full publication history
  • DOI: 10.1002/jmv.1890170106  View/save citation
  • Abstract

    The antibody response against flaviviruses tick-borne encephalitis (TBE), Kyasanur Forest disease (KFD), Murray Valley encephalitis (MVE), West Nile fever (WNF), Japanese B encephalitis (JE), dengue 2 (DEN-2), and yellow fever (YF) was studied in humans after administration of an inactivated TBE virus vaccine.
     Individuals were either prevaccinated with 17D yellow fever (experimental group) or without any previous exposure to flaviviruses (control group). The appearance of serum titres of homologous and heterologous haemagglutination inhibition (HI) antibodies, heterotypic DEN-2 neutralizing antibodies, and TBE enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) antibodies were examined.
    Individuals prevaccinated with the 17D yellow fever developed an antibody pattern that contrasted with that of the control group.
    This pattern was characterized as follows:
     (1) Predominantly anti-TBE IgG antibodies appeared earlier and in higher titres than in the control group,
     (2) heterologous HI antibodies crossreacting with the WN flavivirus subgroup preceded the appearance of homologous HI antibodies,
     (3) a broad spectrum HI response was observed against all flaviviruses tested, and
     (4) low titre heterotypic DEN-2 neutralizing antibodies were formed in about half of the cases. These observations are discussed in the context of cross-reactivity, cross-protection and virus infection enhancement.

fredag 15 september 2017

Ruotsissa käytetty TBE-rokote

onsdag, 17 december 2014 13:13

TBE

Skrivet av

Allmän information

TBE är en virusinfektion som sprids via fästingar. Virus finns i fästingens spottkörtlar och överförs direkt i samband med bettet. Inkubationstiden är ungefär en till två veckor men även längre tider har rapporterats. Symptomen är ofta feber, huvudvärk, kramper och förlamningar. En tredje del får bestående men och dödsfall förekommer. Barn får ofta lindrigare symptom. TBE finns i Sverige huvudsakligen runt Mälaren, Skärgården från Öregrund till Kalmar och runt Vänern och Vättern. TBE finns i de Baltiska staterna, Öststaterna inklusive Ryssland och i Centraleuropa.
I Sverige har det rapporterats omkring 200 fall per år med en viss ökad frekvens de sista åren.

Profylax

Viktigast är att försöka att undvika fästingbett. Använd gärna ljusa plagg /så att man upptäcker fästingarna/, stövlar och byxor nedstoppade innanför stövlarna och långärmat. Myggmedel har en viss effekt. Kolla barnen när man kommit hem. Har man fått en fästing skall den borttagas omgående med tanke på Borrelia.
Vaccin

Vaccination

Det finns två vacciner Encepur och FSME-IMMUN med jämförbar skyddseffekt.
Grund vaccinering bör påbörjas mars-april.
Grundvaccinering av personer under 60 år är 2 vaccineringar med en månads mellanrum och en 3:e 6-12 månader efter den första. Den 4:e tas 3 år efter och sedan upprepas vaccinationen efter 5 år. Äldre över 60 år bör grundvaccineras med 3 doser /intervallet mellan de första 2 doserna bör vara 1 månad och en 3:e dos tas redan 1-2 månader efter den andra/. Den 4:e dosen tas inför nästa säsong. Därefter bör doserna upprepas var 3:e år. Även om det gått lång tid efter 2:a dosen behöver man inte börja om med grund-vaccineringen – diskutera detta med Vaccinationsbyrån.
Barn kan vaccineras från ett år.
Snabbvaccinering kan göras med minst 2 veckor mellan första och andra dosen. Detta gäller personer under 60 år.
Skyddseffekten beräknas till cirka 95% efter grundvaccineringen men något lägre vid snabbvaccinering.
Övergående biverkningar kan förekomma med feber och influensaliknande symptom som försvinner efter något dygn.
Gravida bör endast vaccineras vid vistelse i riskområde under längre tid då klinisk erfarenhet saknas. Ammande kvinnor kan vaccineras.

TBE-virusrokotteista

  •  ROKOTTEISTA

    Tick-borne encephalitis virus vaccines


    P. Noel Barrett, ... Hartmut J. Ehrlich, in Vaccines (Sixth Edition), 2013

    Producers

    TBE vaccines are produced commercially by five manufacturers:
     Baxter AG (Vienna), 
    Novartis Vaccines (Marburg),
     IPVE (Moscow), 
    Microgen (Tomsk, Russia), and
     CIBP (Changchun, China). 
    Both manufacturers of European strain vaccines use essentially the same process to produce the vaccine, the major differences being the use of different strains and the addition of different stabilizers. An overview of the characteristics of the European and Russian vaccines is shown in Table 34-2.

    HSA is used as a stabilizer by Baxter, IPVE, and Microgen, 
    whereas Novartis uses an increased amount of sucrose as a stabilizer

    . Both manufacturers of European strain vaccines provide 
    adult (Baxter, FSME-IMMUN; Novartis, Encepur) and 
    pediatric (Baxter, FSME-IMMUN Junior; Novartis, Encepur-Children) formulations for children older than 1 year. 
     FSME-IMMUN is marketed as TicoVac in some countries. 
    TBE-Moscow has been approved for use in adults since 1982 and has been used to vaccinate more than 25 million people in Russia and neighboring countries.73
      EnceVir was licensed in the Russian Federation in 2001. Russian manufacturers do not offer pediatric formulations, and neither vaccine is licensed for use in children younger than 3 years. 
    TBE-Moscow has been approved for use in children 3 years or older since 1999.73 
     EnceVir was administered to children 3 to 16 years old, but this was temporarily stopped by the Russian Ministry of Healthcare in 2010 owing to postvaccination complications.
     No information is available about the manufacturing process, formulation, or dose schedule for the Chinese vaccine, but it is reported to have passed phase 1, 2, and 3 clinical trials.76
  •  

WHO:n prioriteettilista rokotevalmistelussa

 Kuten alimmalta riviltä huomaa, sille riville joutuu tämä meikäläisen maailman Punkkienkefaliittirokote TBE rokote Ottaen huomoon että etelän itikat eivät elä täällä, mutta jopa jääkauden  ja pakasteolosuhteet kestävä punkki elää, niin paikallisesti pitäisi i priorisoida täällä päin siedettävän hyvää  punkkienkefaliittirokotetta, vaikka ollaankin pikkukansoja ja "pikkukieliä" kuten tässä kuulin suomenkin kielestä sanottavan  radiossa.

WHO:  Immunization standards

Vaccines prequalification priority list 2015-16

High priority vaccines

  • Cholera (oral)
  • DTwP-based combination containing IPV (DTwP-Hep B-Hib-IPV)
  • Dengue
  • Hepatitis A
  • Human Papilloma Virus [HPV]
  • Malaria
  • Measles-Rubella
  • Measles-Mumps-Rubella (MMR)
  • Pneumococcal conjugate
  • Polio (inactivated) [IPV]
  • Polio (bivalent live oral) [bOPV1,3)
  • Rotavirus
  • Typhoid conjugate
  • Yellow fever

Medium priority vaccines

  • BCG
  • Diphtheria-tetanus-pertussis (DTwP)
  • DTwP based pentavalent combination (fully liquid DTwP-Hep B-Hib)
  • DTaP and DTaP combination containing IPV or Hepatitis B
  • Influenza H5N1 for stockpile
  • Influenza seasonal Northern and Southern Hemisphere formulations
  • Measles
  • Meningococcal A-containing conjugate
  • Meningococcal W-containing conjugate
  • Meningococcal ACWY containing conjugate
  • Rabies
  • Tetanus-diphtheria for adults (Td)
  • Varicella

Low priority vaccines

  • DTwP-Hib Fully liquid
  • DTwP-based tetravalent or pentavalent combination containing IPV [DTwP-Hib-IPV or DTwP-IPV]
  • Japanese Encephalitis
  • Meningoccocal AC-containing polysaccharide
  • Meningoccocal W-containing polysaccharide
  • Polio (monovalent live oral type 2) [mOPV2]
  • Polio (monovalent live oral type 3) [mOPV3]
  • Tetanus toxoid (TT)
  • Typhoid non conjugate

No priority

  • Diphtheria-tetanus vaccine for children (DT)
  • DTwP-based tetravalent combination [DTwP-Hep B ; DTwP+Hib (liquid-lyophilized)]
  • DTwP-based pentavalent combination (liquid-lyophilized) [DTwP-Hep B+Hib]
  • Haemophilus influenza type b monovalent
  • Hepatitis B monovalent
  • Influenza H1N1
  • Pneumococcal (polysaccharide)
  • Polio (monovalent live oral type 1) [mOPV1]
  • Polio (trivalent live oral) [tOPV)
  • Rubella monovalent
  • Any other vaccine not in the above priority categories
Vaccines of high programmatic interest that were not available for supply when the 2015-16 priority list was reviewed may be considered for evaluation if they become available before the end of the period during which the list remains current.

Keskustelua TBE-rokotuksista Ruotsin Lääkärilehdessä 10. toukokuuta 2017

http://lakartidningen.se/Opinion/Debatt/2017/05/TBE-vaccination-i-Sverige-ar-ingen-sjalvklarhet/

TBE-vaccination i Sverige är ingen självklarhet

TBE-vaccination i Sverige bör enbart ske i högriskområden. Vaccinationen förhindrar inte en reinfektion, och om detta inträffar är risken påtaglig för värre symtom än om man inte är vaccinerad. Därmed saknas motiv för att införa subvention av TBE-vaccination.

Bengt Fagrell, professor emeritus, Karolinska institutet, Täby

Gustaf Bergstrand, pensionerad docent, neuroradiologi, Täby
 


Fästingsäsongen är i gång och vaccinationscentralerna annonserar flitigt om vaccination mot fästingburen encefalit (TBE). En grundvaccination (3 doser för cirka 1 000 kr) och påfyllnadsdoser efter 3–5 år rekommenderas. Personer >60 år har ett annat schema.
I Läkartidningen framfördes 2016 [1] motiv för att införa subventionerad TBE-vaccination och att överväga ett generellt vaccinationsprogram som i Österrike, där man minskat antalet TBE-fall från 6 till 1/100 000. Vi är inte infektionsläkare men har erfarenheter av svår TBE hos två fullvaccinerade personer. Bägge insjuknade i livshotande symtom som krävde långvarig sjukhusvistelse med intensivvård, respiratorbehandling och drygt årslång rehabilitering. En patient har kvarstående motoriska symtom tre år efter insjuknandet.

I rekommendationer för vaccination mot TBE [2] fastslås att det saknas en enhetlig definition av riskområde. Förslag till regler för TBE-vaccination på läns-, landstings- eller kommunnivå har utarbetats, där incidensen ska vara högre än 1/100 000 och minst 5 fall ska ha förekommit under en 5-årsperiod eller minst 2 fall under ett år.
  • I Stockholms län registrerades 99 fall av TBE år 2013 [2],
  •  i Västra Götaland 19 fall,
  •  i Östergötlands län 8 fall 
  • och i övriga län endast sporadiska fall.
  •  Totalt drabbas årligen 200–300 personer i landet av TBE.
I Linköping har man gjort epidemiologiska och ekologiska studier kring TBE-viruset och dess förekomst inom vissa områden [3].

Under åren 2008–2009 samlades fästingar in från över 2 000 bitna personer i södra och mellersta Sverige, Umeå och på Åland.
 Hos endast 5 av 2 167 analyserade fästingar (0,2 procent) fanns TBE-virus, vilket visar att risken att bli biten av en fästing som bär på TBE-virus är extremt låg även i högriskområden. En svensk studie [4] visar prevalensen 0,26 procent för TBE-virus (alla fästingstadier) i 29 områden. I övriga skandinaviska länder är prevalensen 0,28 procent. Man förklarar den låga prevalensen med att fästingar med TBE-virus bara förekommer i små foci i naturen.

Enligt studien från Linköping [3] hade cirka 50 procent av dem som vaccinerat sig 3 gånger antikroppar mot TBE-virus i blodet, jämfört med 95 procent av dem som fått 5 doser. Detta talar för att man efter 5 doser borde ha ett fullgott skydd. I en svensk studie [5] redovisas dock 27 patienter som trots adekvat vaccination fick kliniska och serologiska belägg för TBE. Mycket svåra symtom förekom i sju fall (1 dödsfall efter 1,5 år), medan resten hade lätta till måttliga symtom trots aktiv immunisering.

Från Slovenien [6] redovisas klart oroande resultat.
Av 2 332 patienter smittade med TBE-virus var 39 (1,7 procent) vaccinerade.
 I jämförelse med matchade, ovaccinerade personer som haft TBE uppvisade de en ökad andel av medvetanderubbning, pares och ökat antal leukocyter. De behövde mer intensivvård och betydligt längre sjukhusvård. Dessa parametrar var signifikant (P <0 den="" gruppen="" haft="" i="" k="" ldersmatchade="" n="" ns-="" och="" ovaccinerade="" p="" rre="" som="" tbe.="" v="">
I Sverige [7] undersöktes nyligen ett flertal neurokognitiva och motoriska parametrar hos 96 patienter med TBE och jämfördes med matchade kontroller. Efter en observationstid på 2–15 år hade de TBE-drabbade patienterna signifikant sämre resultat än kontrollerna, vilket tyder på att TBE kan ge bestående skador.

Sammanfattningsvis anser vi att TBE-vaccination i Sverige enbart bör ske i högriskområden. Vaccinationen förhindrar inte en reinfektion, och om detta inträffar är risken påtaglig för värre symtom än om man inte är vaccinerad. Vi anser därmed att det saknas motiv för att införa subvention av TBE-vaccination i Sverige. TBE-vaccination i det allmänna vaccinationsprogrammet är inte heller motiverat.


(Kommenttini: TÄSTÄ PÄÄTELLEN  ROKOTE EI OLE  TARPEEKSI PÄTEVÄ ANTIGEENIVALINNALTAAN.  ottaen huomooon että saman Flaviiryhmän  virusten rokotteita muutenkin on vaikea  koostaa, niin  tämän rokteen täsmntäminen varmaan vie aikaa. Esim dengue rokote on  kansainväisesti katsoen   tärkeä saada  valmiiksi, samoin uusi samasta ryhmästä  ilmentynyt on ZIKV virus haastaa.
 TBEV  viruksen evaasiomenetelmät  ovat tutkimuksen kohteena  ja varmaan tuovat jotain uutta tähän rokotusprofylaksiaan kun  niitä löytyy. Siis nykyinen TBE rokote ei täytä vaatimuksia tarpeeksi kattavasti.  Se ilmeisesti ei viritä  soluvälitteistä immuunivastetta isäntää puolustavaksi  vaan toisilla jopa johtaa tehostetusti isäntää tuhoavaksi- jotain on vinossa silloin  rokotteen antigeenipainotuksessa.
<0 den="" gruppen="" haft="" i="" k="" ldersmatchade="" n="" ns-="" och="" ovaccinerade="" p="" rre="" som="" tbe.="" v="">Näin ollen  on hyvä että hoidetaan neuroborelioosit kuten nyt on havaittu doksisykliinillä jotta saadaan borreliamäärä ainakin  kehossa alenemaan.  Minusta  on  aikea  saada käsitystä  siitä  miten TBEV virus toimii siten kun borrelia toimii omalla tavallaan kehossa- onko TBEV kehossakin borreliahakuinen,   kai joku siitäkin on kirjoittanut.  Joka tapauksessa on eduksi saada borreliamäärä alas. Kuitenkaan ihmiseltä toiseen ei TBE siirry, kai. 




tisdag 12 september 2017

Miten virukset estävät isäntäkehon komplementin puolustustoimintoja

http://viralzone.expasy.org/811?outline=all_by_protein

The complement system is a major non-specific mechanism of humoral immunity. The activation of complement involves the sequential proteolyis of proteins to generate enzymes with catalytic activities. The biological functions of the complement include opsonization, inflammation, lysis of immune complexes, or enhancement of the humoral immune response.
Members of the herpesvirus, orthopoxvirus and retrovirus families mimic or interact with complement regulatory proteins to block complement activation and neutralization of virus particles. For example, vaccinia and variola viruses encode secreted proteins that block C3(K02765:9606) convertase assembly. Influenza A virus instead blocks the complement pathway via M1(P03485) protein interacting with and inhibiting host C1qA(AF135157:9606) protein.

lördag 9 september 2017

WHO selvittää TBEV:n aiheuttamaa TBE tautia perusteellisesti

http://www.who.int/immunization/sage/6_TBE_backgr_18_Mar_net_apr_2011.pdf

TBE-rokote

Tekstejä:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3755374/

Ruotsin Lääkärilehti kirjoittaa DEBATT- palstalla seuraavaa 13.9. 2017:

  •  TBE- VACCINATION ÄR ANGELÄGEN  Korrekt genomförd TBE-vaccination skyddar mot insjuknande i en mycket allvarlig sjukdom. Trots att många vaccineras har incidenten inte minskat, vilket är en utmaning, skriver Jan Fohlman i en kommentar till en artikel i Läkartidningen tidigare i år (2017; 114: ESWS)
Suomennosta:
TBE-rokotus on tärkeä, kiireellinen.
Asianmukaisesti suoritettu TBE-rokotus suojaa sairastumiselta hyvin vakavaan tautiin.  Huolimatta  monien rokottautumisesta  ei insidenssi ole vähentynyt, mikä on haaste, kirjoittaa Jan Fohlman eräässä kommentissaan Lääkärilehden  artikkeliin  aiemmin tänä vuonna.

Alfaviruksien hyödynnys rokotteiden koostamisessa

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4074933/
Viruses. 2014 Jun; 6(6): 2392–2415.
Published online 2014 Jun 16. doi:  10.3390/v6062392
PMCID: PMC4074933

Alphavirus-Based Vaccines Kenneth Lundstrom

 ( Tämä mahdollisuus  TBEV rokotteen kehittelyssäkin  voisi olla, koska  flaviviruksen ja alfaviruksen viruksen  fuusioprosessissa on samankaltaisuutta. Jollain tavalla olisi  antivirusohjelma saatava viritettyä  TBE-infketiossa, ksoka se on evaasion takia liian pitkässä viiveessä)
kokeita on tehty mm filovirus rokotteen kehittämiseksi - niisähän tulee  jonkinlaisia pitkiä  tubuluksia. Myös TBEV näyttää erään tutkimuksen mukaan tekevän jonkinlaista mikrotubutusta, kuin  ontelonomaavia neuloja, joiden  avulla se vain  "katoaa seinien läpi"  neuronaalisessa materiassa ja siirtää sisältöä  edelleen.  Kun katselin erästä  tutkimustyötä ajattelin että jollain tavalla kuin ebola tuli mieleen noista  putkiloista). 

fredag 8 september 2017

Vuoden 2015 virus: ZIKV, myös aikuiselle voi olla fataali.

J Clin Virol. 2016 Oct;83:63-5. doi: 10.1016/j.jcv.2016.08.297. Epub 2016 Aug 30.

Fatal encephalitis associated with Zika virus infection in an adult.  Soares CN1, Brasil P2, Carrera RM3, Sequeira P4, de Filippis AB4, Borges VA5, Theophilo F5, Ellul MA6, Solomon T6.

 Zikavirus tunnistettiin Amerikassa 2015, kun Brasiliassa tapahtui exanthemaa ilmentävän taudin purkaus. Sen jälkeen lisääntyi mikrokefaliatapaukset ja alettiin epäillä sen  yhteyttä ZIKVin ja tämän neurologisen komplikaation aknssa. Tällä hetkellä ZIKV tunnistetaan  laajaspektristen neurologisten komplikaatioitten  aiheuttajana ja niissä on myös Guillan Barre´-oireyhtymä ja myeliitti. 

  • BACKGROUND: Zika virus (ZIKV) was first identified in the Americas in 2015, when an outbreak of an exanthematous illness occurred in Brazil. Subsequentely, there was an increase of microcephaly cases, suggesting an association between ZIKV and this neurological complication. Currently, ZIKV has been recognised as causing a wide range of neurological complications including Guillain Barré syndrome, and myelitis.

Tässä artikkelissa kuvataan enimmäinen fataali enkefaliitti- tämä tapahtui  47 vuotiaalle raskaanaolevalle naiselle - Hän oli sairastunut Brasilian zikavirusepidemiassa 2016

  • OBJECTIVES: In this report, we describe the first fatal case of encephalitis in a 47 years old non pregnant woman, infected during the Brazilian zika epidemic of 2016.

Enkefaliittidiagnoosi määritettiin tajunnan tason häiriöstä ja fokaalisista neurologisista oireista virusexantheman aikana.

  • STUDY DESIGN: The diagnosis of encephalitis was determined by the presence of a disturbed level of consciousness and focal neurological signs during an exanthemous viral infection.

 Aivoselkäydinnesteestä  tehty analyysi  puolsi viraalia enkefaliittia ja ilmensi lymfosyyttistä  pleosytoosia, korkeaa proteiinipitoisuutta ja  IgM-tyyppisiä Zikavasta-aineita. RT-PCR-analyysi Zikaviruksesta oli positiivinen virtsasta.  Aivojen CT osoitti vahvaa aivoturvotusta.  Tämä tapaus eroaa aiemmista raporteista, koska neurologinen kuva kehkeytyi nopeasti ja hyvin aggressiivisesti johtaen aivokuolemaan  11 päivän kuluttua sairaalaan tulosta.

  • RESULTS: CSF analysis supported the diagnosis of viral encephalitis, revealing lymphocytic pleocytosis, a high protein concentration, and the presence of IgM zika antibodies. RT-PCR analysis for ZIKV was positive in the urine. A brain computed tomography showed massive brain swelling. Our case differs from previous reports, because her neurological picture developed rapidly and in a very aggressive manner leading to brain death after eleven days of admission.

Yhteenvetona: Endeemisillä alueilla ZIKV pitäisi katsoa   enkefaliittitapuksissa  yhdeksi etiologiseksi  tekijäksi   ja kliinikoiden  tulisi olla tietoisia sen mahdollisesta vakavuudesta. 

  • CONCLUSION: In endemic areas, ZIKV should be considered as an aetiological agent in cases of encephalitis, and clinicians should be aware of its potential severity.

 Avainsanoja: Aivotulehdus, neurologiset ilmiöt, Zikavirus.

  • KEYWORDS: Encephalitis; Neurological manifestations; Zika virus

 

ZIKV viruksesta on hyvää tietoa jo nyt!

https://www.slideshare.net/UCSFGlobalHealthSciences/zika-virus-virology-and-relationship-to-other-flaviviruses?next_slideshow=1
ZIKV  infektio  sikiökehityksen aikan tekee syvästi taantuneen  kehitysvammaisen, koska  virus tuhoaa hermokudosta ja aivojen ja aistinelinten  kehityksen. Se iskee hermon progeniittorisoluun.


Etsin punkkienkefaliittiviruksen kaavakuvaa, mutta...tässä on toinen flavivirus ZIKV

Näistä flaviviruksista tulee esiin vain Zikaviruksen kuva lähinnä.  Se on kyllä hyvin kartoitettu, mutta olisi pitänyt kartoittaa punkkienkefaliittivirus TBEV  ensin paremmin ja havaita sen evaasiot ja anntiviraalit  potentiaaliset lääkkeet , että voidaan sitten käsitellä Zikavirus, Nyt jää punkkienkefaliittivirus TBEV  jälleen  vähemmälle  huomiolle, vaikka se on oikeastaan  relevantimpi siksi että sen historia on niin pitkä ja  sen mustan  aukon kohdat  tunnistetaan suurin piirtein-  ja  Zika on samannäköinen-  mutta aiheuttaa  jo niin nopeat katastrofaaliset  taudit,  jotta  asia on livennyt hallinnasta jo siihen tasoon, että  ehkä ajatellaan mieluummin " annihiloida maailman itikat".

Tässä ollaan joudutti aikojen bermudaan.

Zikavirus  on flavivirus  kuten puutiaisaivokuumevirus.  TBEV.
Saan ainakin Zikaviruksen kuvan tähän.
http://viralzone.expasy.org/24?outline=all_by_species

Flavivirus

More on Zika virus here

VIRION


Enveloped, spherical, about 50 nm in diameter. The surface proteins are arranged in an icosahedral-like symmetry. Mature virions contain two virus-encoded membrane proteins (M and E), while immature virions contain a membrane protein precursor (prM).
Source: Zhang et al(Pubmed )

GENOME

Monopartite, linear, ssRNA(+) genome of of 10-11 kb. The genome 5' end has a methylated nucleotide cap for canonical cellular translation. The 3' terminus is not polyadenylated but forms a loop structure. This secondary structure leads to the formation of a subgenomic flavivirus RNA (sfRNA) through genomic RNA degradation by host XRN1. sfRNA is essential for pathogenicity , and may play a role in inhibiting host RIG-I antiviral activity as shown for Dengue virus

GENE EXPRESSION

The virion RNA is infectious and serves as both the genome and the viral messenger RNA. The whole genome is translated in a polyprotein, which is processed co- and post-translationally by host and viral proteases.

REPLICATION

  1. Attachement of the viral envelope protein E to host receptors mediates internalization into the host cell by clathrin-mediated endocytosis, or by apoptotic mimicry
  2. Fusion of virus membrane with host endosomal membrane. RNA genome is released into the cytoplasm.
  3. The positive-sense genomic ssRNA is translated into a polyprotein, which is cleaved into all structural and non structural proteins (to yield the replication proteins).
  4. Replication takes place at the surface of endoplasmic reticulum in cytoplasmic viral factories. A dsRNA genome is synthesized from the genomic ssRNA(+).
  5. The dsRNA genome is transcribed/replicated thereby providing viral mRNAs/new ssRNA(+) genomes.
  6. Virus assembly occurs at the endoplasmic reticulum. The virion buds at the endoplasmic reticulum and is transported to the Golgi apparatus.
  7. The prM protein is cleaved in the Golgi, thereby maturing the virion which is fusion competent.
  8. Release of new virions by exocytosis.

TBE- rokote , Rokote punkkienkefaliittia vastaan

https://www.1177.se/Vastra-Gotaland/Tema/Vaccinationer/Vaccinationer/Vaccination-mot-TBE/?ar=True

Flavivirusrokotteiden tilanne 2017

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28486135

Recent advances in human flavivirus vaccines.

Abstract

Dengue (DENV), West Nile (WNV) and Zika (ZIKV) viruses are mosquito-transmitted flaviviruses that cause thousands of human deaths and millions of illnesses each year. In the last decades, epidemic outbreaks of all three flaviviruses emerged and caused a major health and economical problem in many parts of the world. The increasing and expanding burden of flaviviruses has highlighted the need for effective human vaccines against all three viruses. This review provides an overview of the recent progress in DENV, WNV and ZIKV vaccines development with specific focus on candidates in human clinical development.
PMID:
28486135
DOI:
10.1016/j.coviro.2017.04.002

Punkin aiheuttamista taudeista pahempi: virusenkefaliitti TBE.

Punkki aiheuttaa bakterritautia borrelioosia ja borrelia on spirokeetta. Tähän tehoaa hyvin doksisykliinikuuri.
Mutta punkin syljessä voi tulla kehoon jo  heti TBE-virus.
Katso tämä opettavainen video vuodelta 2014.
 
olennaista on kartoittaa, miten virus ja bakteeri tekevät evaasion ihmisen puolustusjärjestelmistä ja taudit pääsevät  muodosotumaan toisilla yksilöillä  pahoiksi. 
Sitä myöten kun kaikki evaasiojärjestelmät selkiävät, löytynea myös jokin uusi terapiamahdollisuus. 

Antivirusstrategia TBEV:: tä vastaan

PubMed haku antaa 7  relevanttia vastausta joka hahmottaa  aikamme tilannetta.

Lindqvist R, Mundt F, Gilthorpe JD, Wölfel S, Gekara NO, Kröger A, Överby AK.
J Neuroinflammation. 2016 Oct 24;13(1):277.

Abstract

BACKGROUND: Neurotropic flaviviruses such as tick-borne encephalitis virus (TBEV), Japanese encephalitis virus (JEV), West Nile virus (WNV), and Zika virus (ZIKV) are causative agents of severe brain-related diseases including meningitis, encephalitis, and microcephaly. We have previously shown that local type I interferon response within the central nervous system (CNS) is involved in the protection of mice against tick-borne flavivirus infection. However, the cells responsible for mounting this protective response are not defined.

METHODS: Primary astrocytes were isolated from wild-type (WT) and interferon alpha receptor knock out (IFNAR-/-) mice and infected with neurotropic flaviviruses. Viral replication and spread, IFN induction and response, and cellular viability were analyzed. Transcriptional levels in primary astrocytes treated with interferon or supernatant from virus-infected cells were analyzed by RNA sequencing and evaluated by different bioinformatics tools.

RESULTS:Here, we show that astrocytes control viral replication of different TBEV strains, JEV, WNV, and ZIKV. In contrast to fibroblast, astrocytes mount a rapid interferon response and restrict viral spread. Furthermore, basal expression levels of key interferon-stimulated genes are high in astrocytes compared to mouse embryonic fibroblasts. Bioinformatic analysis of RNA-sequencing data reveals that astrocytes have established a basal antiviral state which contributes to the rapid viral recognition and upregulation of interferons. The most highly upregulated pathways in neighboring cells were linked to type I interferon response and innate immunity. The restriction in viral growth was dependent on interferon signaling, since loss of the interferon receptor, or its blockade in wild-type cells, resulted in high viral replication and virus-induced cytopathic effects. Astrocyte supernatant from TBEV-infected cells can restrict TBEV growth in astrocytes already 6 h post infection, the effect on neurons is highly reinforced, and astrocyte supernatant from 3 h post infection is already protective.

CONCLUSIONS:These findings suggest that the combination of an intrinsic constitutive antiviral response and the fast induction of type I IFN production by astrocytes play an important role in self-protection of astrocytes and suppression of flavivirus replication in the CNS.

Free PMC Article
2.
Kurhade C, Zegenhagen L, Weber E, Nair S, Michaelsen-Preusse K, Spanier J, Gekara NO, Kröger A, Överby AK.
J Neuroinflammation. 2016 Jan 27;13:22. doi: 10.1186/s12974-016-0487-9.

Abstract

BACKGROUND: Although type I interferons (IFNs)-key effectors of antiviral innate immunity are known to be induced via different pattern recognition receptors (PRRs), the cellular source and the relative contribution of different PRRs in host protection against viral infection is often unclear. IPS-1 is a downstream adaptor for retinoid-inducible gene I (RIG-I)-like receptor signaling. In this study, we investigate the relative contribution of IPS-1 in the innate immune response in the different brain regions during infection with tick-borne encephalitis virus (TBEV), a flavivirus that causes a variety of severe symptoms like hemorrhagic fevers, encephalitis, and meningitis in the human host.

METHODS: IPS-1 knockout mice were infected with TBEV/Langat virus (LGTV), and viral burden in the peripheral and the central nervous systems, type I IFN induction, brain infiltrating cells, and inflammatory response was analyzed.

RESULTS: We show that IPS-1 is indispensable for controlling TBEV and LGTV infections in the peripheral and central nervous system. Our data indicate that IPS-1 regulates neuropathogenicity in mice. IFN response is differentially regulated in distinct regions of the central nervous system (CNS) influencing viral tropism, as LGTV replication was mainly restricted to olfactory bulb in wild-type (WT) mice. In contrast to the other brain regions, IFN upregulation in the olfactory bulb was dependent on IPS-1 signaling. IPS-1 regulates basal levels of antiviral interferon-stimulated genes (ISGs) like viperin and IRF-1 which contributes to the establishment of early viral replication which inhibits STAT1 activation. This diminishes the antiviral response even in the presence of high IFN-β levels. Consequently, the absence of IPS-1 causes uncontrolled virus replication, in turn resulting in apoptosis, activation of microglia and astrocytes, elevated proinflammatory response, and recruitment of inflammatory cells into the CNS.

CONCLUSIONS: We show that LGTV replication is restricted to the olfactory bulb and that IPS-1 is a very important player in the olfactory bulb in shaping the innate immune response by inhibiting early viral replication and viral spread throughout the central nervous system. In the absence of IPS-1, higher viral replication leads to the evasion of antiviral response by inhibiting interferon signaling. Our data suggest that the local microenvironment of distinct brain regions is critical to determine virus permissiveness.

Free PMC Article
3.
Sedenkova KN, Dueva EV, Averina EB, Grishin YK, Osolodkin DI, Kozlovskaya LI, Palyulin VA, Savelyev EN, Orlinson BS, Novakov IA, Butov GM, Kuznetsova TS, Karganova GG, Zefirov NS.
Org Biomol Chem. 2015 Mar 21;13(11):3406-15. doi: 10.1039/c4ob02649g.

Tick-borne encephalitis virus (TBEV) belonging to Flavivirus genus causes severe infection in humans. The search for therapeutically relevant compounds targeting TBEV requires the exploration of novel chemotypes. A versatile synthesis of previously unknown 4-aminopyrimidines and 4-aminopyrimidine N-oxides based on a fluorosubstituted heterocyclic core is described. A representative series of 4-aminotetrahydroquinazoline derivatives, containing aliphatic and aromatic substituents as well as the adamantane framework, was obtained and their activity against tick-borne encephalitis virus reproduction was studied. Nine compounds were found to inhibit TBEV entry into the host cells. A bulky hydrophobic adamantyl group was identified to be important for the antiviral activity. The developed synthetic route allowed an easy access to a consistent compound library for further structure-activity relationship studies.
4.
Weber E, Finsterbusch K, Lindquist R, Nair S, Lienenklaus S, Gekara NO, Janik D, Weiss S, Kalinke U, Överby AK, Kröger A.
J Virol. 2014 Nov;88(21):12202-12. doi: 10.1128/JVI.01215-14. Epub 2014 Aug 13.
Vector-borne flaviviruses, such as tick-borne encephalitis virus (TBEV), West Nile virus, and dengue virus, cause millions of infections in humans. TBEV causes a broad range of pathological symptoms, ranging from meningitis to severe encephalitis or even hemorrhagic fever, with high mortality. Despite the availability of an effective vaccine, the incidence of TBEV infections is increasing. Not much is known about the role of the innate immune system in the control of TBEV infections. Here, we show that the type I interferon (IFN) system is essential for protection against TBEV and Langat virus (LGTV) in mice. In the absence of a functional IFN system, mice rapidly develop neurological symptoms and succumb to LGTV and TBEV infections. Type I IFN system deficiency results in severe neuroinflammation in LGTV-infected mice, characterized by breakdown of the blood-brain barrier and infiltration of macrophages into the central nervous system (CNS). Using mice with tissue-specific IFN receptor deletions, we show that coordinated activation of the type I IFN system in peripheral tissues as well as in the CNS is indispensable for viral control and protection against virus induced inflammation and fatal encephalitis.

IMPORTANCE: The type I interferon (IFN) system is important to control viral infections; however, the interactions between tick-borne encephalitis virus (TBEV) and the type I IFN system are poorly characterized. TBEV causes severe infections in humans that are characterized by fever and debilitating encephalitis, which can progress to chronic illness or death. No treatment options are available. An improved understanding of antiviral innate immune responses is pivotal for the development of effective therapeutics. We show that type I IFN, an effector molecule of the innate immune system, is responsible for the extended survival of TBEV and Langat virus (LGTV), an attenuated member of the TBE serogroup. IFN production and signaling appeared to be essential in two different phases during infection. The first phase is in the periphery, by reducing systemic LGTV replication and spreading into the central nervous system (CNS). In the second phase, the local IFN response in the CNS prevents virus-induced inflammation and the development of encephalitis.

Free PMC Article
5.
De Burghgraeve T, Kaptein SJ, Ayala-Nunez NV, Mondotte JA, Pastorino B, Printsevskaya SS, de Lamballerie X, Jacobs M, Preobrazhenskaya M, Gamarnik AV, Smit JM, Neyts J.
PLoS One. 2012;7(5):e37244. doi: 10.1371/journal.pone.0037244. Epub 2012 May 18.
There is an urgent need for potent inhibitors of dengue virus (DENV) replication for the treatment and/or prophylaxis of infections with this virus. We here report on an aglycon analogue of the antibiotic teicoplanin (code name LCTA-949) that inhibits DENV-induced cytopathic effect (CPE) in a dose-dependent manner. Virus infection was completely inhibited at concentrations that had no adverse effect on the host cells. These findings were corroborated by quantification of viral RNA levels in culture supernatant. Antiviral activity was also observed against other flaviviruses such as the yellow fever virus and the tick-borne encephalitis virus (TBEV). In particular, potent antiviral activity was observed against TBEV. Time-of-drug-addition experiments indicated that LCTA-949 inhibits an early stage in the DENV replication cycle; however, a virucidal effect was excluded. This observation was corroborated by the fact that LCTA-949 lacks activity on DENV subgenomic replicon (that does not encode structural proteins) replication. Using a microscopy-based binding and fusion assay employing DiD-labeled viruses, it was shown that LCTA-949 targets the early stage (binding/entry) of the infection. Moreover, LCTA-949 efficiently inhibits infectivity of DENV particles pre-opsonized with antibodies, thus potentially also inhibiting antibody-dependent enhancement (ADE). In conclusion, LCTA-949 exerts in vitro activity against several flaviviruses and does so (as shown for DENV) by interfering with an early step in the viral replication cycle.Free PMC Article
6.
Aberle JH, Aberle SW, Kofler RM, Mandl CW.
J Virol. 2005 Dec;79(24):15107-13.
A new vaccination principle against flaviviruses, based on a tick-borne encephalitis virus (TBEV) self-replicating noninfectious RNA vaccine that produces subviral particles, has recently been introduced (R. M. Kofler, J. H. Aberle, S. W. Aberle, S. L. Allison, F. X. Heinz, and C. W. Mandl, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 7:1951-1956, 2004).
 In this study, we evaluated the potential of the self-replicating RNA vaccine in mice in comparison to those of live, attenuated vaccines and a formalin-inactivated whole-virus vaccine (ImmunInject). For this purpose, mice were immunized using gene gun-mediated application of the RNA vaccine and tested for CD8+ T-cell responses, long-term duration, neutralizing capacity, and isotype profile of specific antibodies and protection against lethal virus challenge. We demonstrate that the self-replicating RNA vaccine induced a broad-based, humoral and cellular (Th1 and CD8+ T-cell response) immune response comparable to that induced by live vaccines and that it protected mice from challenge. Even a single immunization with 1 microg of the replicon induced a long-lasting antibody response, characterized by high neutralizing antibody titers, which were sustained for at least 1 year. Nevertheless, it was possible to boost this response further by a second injection with the RNA vaccine, even in the presence of a concomitant CD8+ T-cell response. In this way it was possible to induce a balanced humoral and cellular immune response, similar to infection-induced immunity but without the safety hazards of infectious agents. The results also demonstrate the value of TBEV replicon RNA for inducing protective long-lasting antiviral responses.
Free PMC Article
7.
Gritsun TS, Lashkevich VA, Gould EA.
Antiviral Res. 2003 Jan;57(1-2):129-46. Review.
Abstract Tick-borne encephalitis (TBE) is one of the most dangerous human infections occurring in Europe and many parts of Asia. The etiological agent Tick-borne encephalitis virus (TBEV), is a member of the virus genus Flavivirus, of the family Flaviviridae. TBEV is believed to cause at least 11,000 human cases of encephalitis in Russia and about 3000 cases in the rest of Europe annually. Related viruses within the same group, Louping ill virus (LIV), Langat virus (LGTV) and Powassan virus (POWV), also cause human encephalitis but rarely on an epidemic scale. Three other viruses within the same group, Omsk hemorrhagic fever virus (OHFV), Kyasanur Forest disease virus (KFDV) and Alkhurma virus (ALKV), are closely related to the TBEV complex viruses and tend to cause fatal hemorrhagic fevers rather than encephalitis. This review describes the clinical manifestations associated with TBEV infections, the main molecular-biological properties of these viruses, and the different factors that define the incidence and severity of disease. The role of ticks and their local hosts in the emergence of new virus variants with different pathogenic characteristics is also discussed. This review also contains a brief history of vaccination against TBE including trials with live attenuated vaccine and modern tendencies in developing of vaccine virus strains.

Puutiaisaivotulehdus, Punkkienkefaliitti TBE

https://www.thl.fi/sv/web/infektiotaudit/taudit-ja-mikrobit/virustaudit/puutiaisaivotulehdus

Puutiaisaivotulehdus

Mikä on puutiaisaivotulehdus?

Puutiaisaivotulehdus (tick borne encephalitis, TBE, Kumlingen tauti, puutiaisaivokuume) on flaviviruksiin kuuluvan TBE-viruksen aiheuttama enkefaliitti eli aivotulehdus. Puutiaisaivotulehdusta esiintyy Keski-Euroopasta Siperian läpi Japaniin asti ulottuvalla leveällä vyöhykkeellä. TBE-virusta on kolmea eri tyyppiä: läntinen, siperialainen ja Kaukoidän tyyppi.
Punkit levittävät myös borrelioosia eli Lymen tautia, joka on eri sairaus kuin puutiaisaivotulehdus.

Miten puutiaisaivotulehdus tarttuu?

TBE-virus leviää Ixodes-puutiaisen pureman välityksellä. TBE-virus tarttuu muutamassa minuutissa punkin syljestä jo pureman alkuvaiheessa. Myös punkkien nymfit ja toukat voivat levittää virusta, niiden puremaa ei yleensä havaita. Baltian maissa tartuntoja on kuvattu tapahtuneen myös pastöroimattoman maidon välityksellä.

Mitkä ovat puutiaisaivotulehduksen oireet?

Puutiaisaivotulehdus on taudinkuvaltaan kaksivaiheinen. Oireita ilmenee vain 10─30 prosentilla tartunnan saaneista. Aika puremasta ensimmäisiin oireisiin voi vaihdella 4─28 vrk välillä. Yleensä noin viikon kuluttua puremasta potilaalla on kuumeilua ja epämääräistä pahaa oloa ja sairauden tunnetta. Tämä vaihe kestää yleensä noin 4─7 päivää ja valtaosa infektioista päättyy tähän.
Noin viikon (3–21 vuorokauden) kuumeettoman jakson jälkeen 20─30 prosenttia sairastuneista saa varsinaisen aivotulehduksen. Aivotulehdusjakson aikana potilaalla on kuumetta, päänsärkyä, niskajäykkyyttä, valon arkuutta, pahoinvointia ja mahdollisesti muita neurologisia oireita, kuten tajunnanhäiriöitä, kouristuksia tai halvausoireita.

Kuolleisuus puutiaisaivotulehdukseen on hyvin pieni, noin 0,5─1 prosenttia. Suurelle osalle varsinaiseen aivokuumeeseen sairastuneista jää kuitenkin pitkäkestoisia ja 2─10 prosentille jopa pysyviä keskushermosto-oireita. Jälkioireista tavallisia ovat ärtyneisyys, muisti- ja keskittymisvaikeudet, kuulovauriot, raajan halvaukset ja lihasheikkous.

Miten puutiaisaivotulehdus todetaan?

Tuoreessa puutiaisaivotulehduksessa muodostuu TBE-virusvasta-aineita, jotka voidaan todeta verikokeella. Myös selkäydinnesteestä voidaan tutkia vasta-aineet. Kerran sairastettu tauti jättää elinikäisen suojan eli immuniteetin.

Miten puutiaisaivotulehdusta hoidetaan?

Puutiaisaivotulehdus on virustauti eikä siihen ole tarjolla lääkehoitoa. Aivotulehduksen hoito vaatii sairaalahoitoa.

Miten puutiaisaivotulehduksen tarttuminen ehkäistään?

Suojaudu ja käytä karkoitteita

Liikuttaessa luonnossa puutiaisaivotulehdusalueella, tulisi pukeutua pitkähihaiseen ja -lahkeiseen vaatetukseen, ja käyttää esimerkiksi Punkki-OFFia paljaaksi jäävälle ihoalueelle. Perinteinen punkkisyyni kerran vuorokaudessa ei auta puutiaisaivotulehduksen ehkäisyssä, mutta se on tarpeen borrelioosin tarttumisen estämisessä. 

Rokote

Puutiaisaivotulehdusta vastaan on olemassa rokote, ks. rokotukset.

Evaasiostrategiaa TBEV viruksella. IFN viive.

VIIVE antiviraaliseen  IFN-järjestelmään


Euroopassa ja Aasiassa aiheutuu vuosittain noin 10 000 vakavaa punkkisyntyistä enkefaliittia (TBE) , punkin aiheuttamaa aivotulehdusta.

 Tässä tutkimuksessa tarkastettiin TBE-viruksen tapoja  vaikuttaa antivirustyyppistä interferonia IFN- alfa/beta- esiintyikö sitä ollenkaan?  Tiedetään että tämä virus käyttää monta evaasiomenetelmää ihmis-isäntänsä suhteen. 

Tutkimuksessa käytettiin viruskantoja Neudörfl, Hypr ja Absettarov ja havaittiin, että IFN-beta transkriptit ja viruksen RNA korreloivat tarkasti keskenään. Lisäksi IFN-indusoituminen TBEV viruksesta riippui IFN-transkriptiotekijän säätelyfaktorista IRF-3. Kuitenkin jopa vahvimmin IFN-indusoitumisaktiivisuutta ja korkeimpia RNA-pituisuuksia omaava kanta osoitti  huomattavaa viivettä IRF-3:n aktivoitumisessa. Tästä johtuen TBEV saattoi pitää matalia, kynnyksen alla olevia IFN-transkriptitasoja, joten solut eivät kyenneet vapauttamaan tuottunutta  IFN interferonia. Vasta 24 tunnin päästä oli kumuloitunut sen verran riittävästi IFN- transkriptejä että saattoi tuottua havaittavia määriä erittyneitä interferoneja. 
Tämä viive IFN-induktiossa ei näytä aiheutuvan spesifisestä virusproteiinista, koska TBEV C, E, NS2A, NS2B, NS3, NS4A, NS4B, NS5 ja NS2B-NS3 sekä myös TBEV infektio itse eivät ilmennä mitään vaikutusta spesifiseen IFN-beta induktioon.

 Kuitenkin tutkijaryhmä havaitsi, että tämän  viruksen dsRNA sinänsä  on vahva IFN- vasteen esiin liipaisija, mutta sitä muotoa on vain intrasellulaarisen kalvon aitioiden sisällä. Siitä huolimatta IFN:n indusoitumisen riippuvuus IFN-promoottorin 1 stimulaatiosta ( IPS-1) samoin kuin eukaryooottisen aloitusfaktorin alfa-alayksiköstä (eIF2alpha) viittaisi jonkinlaiseen sytoplasmiseen altistumiseen jollekin määrälle viruksen dsRNA muotoa infektion myöhäisvaiheessa. 

Tutkijat pystyivät osoittamaan tällä viruksella TBEV kuten muillakin flaviviruksilla , että se järjestelee uudestaan  solunsisäisiä kalvojaan. Viruspartikkelit ja membraaniin yhteydessä olevat rakkulat ( jotka todennäköisesti edustavat virusRNA-synteesikohtia) olivat  havaittavissa endoplasmisen retikulumin sisällä. Täten ilmeisesti TBEV järjestelee uudestaan solun sisäisiä kalvoja tarjoten aitiota omalle dsRNA:lleen , joka on suurimmalta osaltaan saavuttamattomissa sytoplasmisten patogeenireseptorien tunnistamissyrityksiltä. Tämä viivyttää IFN-induktion alkuunpanoa sen verran riittävästi, että salliutuu progeniittoripartikkeleitten tuotannon alkuunpääsy noin 24 tunninkohdalla.



LÄHDE:
J Virol. 2010 Sep;84(17):8470-83. doi: 10.1128/JVI.00176-10. Epub 2010 Jun 16.
Tick-borne encephalitis virus delays interferon induction and hides its double-stranded RNA in intracellular membrane vesicles.
Abstract
Tick-borne encephalitis virus (TBEV) (family Flaviviridae, genus Flavivirus) accounts for approximately 10,000 annual cases of severe encephalitis in Europe and Asia. Here, we investigated the induction of the antiviral type I interferons (IFNs) (alpha/beta IFN [IFN-alpha/beta]) by TBEV. Using strains Neudörfl, Hypr, and Absettarov, we demonstrate that levels of IFN-beta transcripts and viral RNA are strictly correlated. Moreover, IFN induction by TBEV was dependent on the transcription factor IFN regulatory factor 3 (IRF-3). However, even strain Hypr, which displayed the strongest IFN-inducing activity and the highest RNA levels, substantially delayed the activation of IRF-3. As a consequence, TBEV can keep the level of IFN transcripts below the threshold value that would permit the release of IFN by the cell. Only after 24 h of infection have cells accumulated sufficient IFN transcripts to produce detectable amounts of secreted IFNs. The delay in IFN induction appears not to be caused by a specific viral protein, since the individual expressions of TBEV C, E, NS2A, NS2B, NS3, NS4A, NS4B, NS5, and NS2B-NS3, as well as TBEV infection itself, had no apparent influence on specific IFN-beta induction.

We noted, however, that viral double-stranded RNA (dsRNA), an important trigger of the IFN response, is immunodetectable only inside intracellular membrane compartments. Nonetheless, the dependency of IFN induction on IFN promoter stimulator 1 (IPS-1) as well as the phosphorylation of the alpha subunit of eukaryotic initiation factor 2 (eIF2alpha) suggest the cytoplasmic exposure of some viral dsRNA late in infection. Using ultrathin-section electron microscopy, we demonstrate that, similar to other flaviviruses, TBEV rearranges intracellular membranes. Virus particles and membrane-connected vesicles (which most likely represent sites of virus RNA synthesis) were observed inside the endoplasmic reticulum. Thus, apparently, TBEV rearranges internal cell membranes to provide a compartment for its dsRNA, which is largely inaccessible for detection by cytoplasmic pathogen receptors. This delays the onset of IFN induction sufficiently to give progeny particle production a head start of approximately 24 h.
PMID:
20554782
PMCID:
PMC2919015
DOI:
10.1128/JVI.00176-10
[Indexed for MEDLINE]
Suomennos 8.9. 2017